住在一個古老文明與未來科技共存的葫蘆小島上。小人魚咕嚕遭遇海怪襲擊，被人類小男孩魚丸救起。“淘氣”小咕嚕遇上“萌寶”小魚丸，兩人建立了深厚的友誼。在魚丸遇到危險后，找到了媽媽的咕嚕堅持要去救魚丸。

慈祥和藹的人類老人，魚丸的爺爺，撫養魚丸長大。是咕嚕的人類朋友，幫助咕嚕從海怪手中救出人魚媽媽。

人類小男孩,和爺爺相依為命。剛上小學的魚丸,對一切新鮮事物都敢于嘗試,與咕嚕相遇后,和爺爺一起幫助她尋找媽媽。在海上,他們一面要和神經博士的人馬斗智斗勇,一面還要從海怪手中救出咕嚕的媽媽。

美人魚,咕嚕的媽媽,也是美人魚一族的公主,人魚體內的鉆石含有巨大的能量。被可怕的海怪抓走了,之后在勇敢的咕嚕和人類朋友的幫助下獲救。

人類科學家,做夢都想得到美人魚的神經博士。博士想要抓獲小美人魚目的是橫發奇財,為了自己的研究可以放棄人類的感情。博士最終被魚丸和爺爺感化。

擁有能操縱大自然的力量,渴望得到人魚一族的鉆石,海怪搜捕美人魚是為了食其肉而達到長生不老,從而支配一切生物。最終被魚丸殺死。